2021-4-9 | 釀酒工業(yè)論文
作者:曹喜濤 陳凱 李揚(yáng) 竇潔 王慧 周長(zhǎng)林 奚濤 單位:中國(guó)藥科大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 江蘇科技大學(xué)蠶業(yè)研究所
S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,SAM)是一種廣泛存在于生物體內(nèi)并且具有重要生理功能的活性物質(zhì)。它參與體內(nèi)核酸、蛋白質(zhì)、磷脂、體內(nèi)激素和神經(jīng)遞質(zhì)生物合成和代謝等40多種生物反應(yīng)[6-7]。可用于治療抑郁癥[8]、關(guān)節(jié)炎[9]、肝功能紊亂等疾病[10]、阿爾茲海默病[11],具有起效快,副作用小,安全可靠等特點(diǎn)。隨著SAM的價(jià)值逐漸被人們所認(rèn)識(shí),市場(chǎng)需求量也日趨增長(zhǎng)[12]。目前美國(guó)市場(chǎng)常見的SAM成品藥主要為歐洲進(jìn)口的硫酸對(duì)甲苯磺酸鹽雙鹽,還有部分產(chǎn)品為美國(guó)產(chǎn)穩(wěn)定性更好的聚丁基磺酸鹽。而國(guó)內(nèi)盡管進(jìn)行了很多研究,但一直未能實(shí)現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)。釀酒酵母是常見的真核生物,并且其全基因組序列已經(jīng)測(cè)定完成,被美國(guó)食品與藥品安全管理局(FDA)認(rèn)證為安全的微生物(GRAS,Generallyrecognizedassafe)[13]。利用釀酒酵母生產(chǎn)SAM已有的研究主要集中在高產(chǎn)菌株的篩選和誘變[14-17]、發(fā)酵條件的優(yōu)化[18-24]、SAM2的過表達(dá)和DNAShuffling[25-31]、CBS基因敲除[32]等,但是這些研究主要集中在單個(gè)基因的過表達(dá)或者敲除的研究,同時(shí)也未見商業(yè)化應(yīng)用的報(bào)道。本文采用gTME技術(shù),通過對(duì)RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的TATA結(jié)合蛋白之一的SPT15和TATA結(jié)合蛋白相關(guān)因子之一TAF25編碼的基因進(jìn)行易錯(cuò)PCR,建立突變文庫(kù),構(gòu)建重組釀酒酵母菌株,研究了gTME對(duì)釀酒酵母SAM代謝的影響,為獲得工業(yè)化生產(chǎn)菌株建立基礎(chǔ)。
1材料與試劑
1.1質(zhì)粒和菌種pMD18-TVector克隆載體購(gòu)自Takara公司,質(zhì)粒pFA6a-GFPS65T-kanMX6由天津大學(xué)王靜宇惠贈(zèng),質(zhì)粒pYES2.0由中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院趙云坡博士惠贈(zèng),大腸桿菌E.coliDH5α、釀酒酵母S.cerevisiaeCGMCC2846由中國(guó)藥科大學(xué)微生物教研室保存。
1.2試劑限制性內(nèi)切酶EcoRI、BamHI、NheI、T4DNA連接酶、Taq酶、PCR相關(guān)試劑、質(zhì)粒提取試劑盒均購(gòu)自Takara公司。限制性內(nèi)切酶AgeI、凝膠回收試劑盒購(gòu)自Fermentas公司,氨芐青霉素鈉鹽、Geneticin(G418硫酸鹽)購(gòu)自北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司。易錯(cuò)PCR試劑盒為藍(lán)罡生物購(gòu)自北京柏萊斯特科技發(fā)展有限公司。引物合成、DNA測(cè)序由南京金斯瑞生物科技有限公司完成。1.3培養(yǎng)基大腸桿菌用LB培養(yǎng)基培養(yǎng)(g/L):酵母提取物5,胰蛋白胨10,NaCl10,轉(zhuǎn)化子培養(yǎng)時(shí)添加50μg/mL氨芐青霉素。釀酒酵母用YPD培養(yǎng)基培養(yǎng)(g/L):酵母提取物10,蛋白胨10,葡萄糖20,固體培養(yǎng)基加入2%瓊脂粉和120μg/mLG418。篩選高產(chǎn)SAM菌株時(shí)采用O-medium(g/L)[33]:葡萄糖50,蛋白胨10,酵母提取物5,KH2PO44,K2HPO42,MgSO4•7H2O1.5,L-met3,pH6.0。
2方法
2.1釀酒酵母S.cerevisiaeCGMCC2846基因組的提取根據(jù)參考文獻(xiàn)[34]采用玻璃珠破碎的方法提取釀酒酵母基因組,作為擴(kuò)增SPT15和TAF25基因的模板。
2.2spt15和taf25基因的克隆及其易錯(cuò)PCR文庫(kù)的建立本研究中所用的引物見表1。轉(zhuǎn)錄因子spt15和taf25采用PCR的方法,以釀酒酵母總DNA為模板,擴(kuò)增出的基因經(jīng)瓊脂糖凝膠試劑盒回收后,與pMD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coliDH5α。將正確轉(zhuǎn)化的E.coliDH5α由南京金斯瑞生物科技有限公司進(jìn)行DNA測(cè)序。測(cè)得的基因序列登陸NCBI數(shù)據(jù)庫(kù),進(jìn)行序列比對(duì)。以獲得的SPT15和TAF25基因?yàn)槟0澹罁?jù)易錯(cuò)PCR試劑盒的說明進(jìn)行易錯(cuò)PCR,構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子spt15和taf25的易錯(cuò)PCR文庫(kù)。
2.3重組釀酒酵母表達(dá)載體pYES-KanMX的構(gòu)建和重組釀酒酵母篩選根據(jù)質(zhì)粒pYES2.0酶切位點(diǎn)的特性,選擇G418基因的插入位點(diǎn)。引物Kan-F/Kan-R用于擴(kuò)增G418基因,在正向引物中引入NheI的酶切位點(diǎn),反向引物中引入NdeI的酶切位點(diǎn)。以質(zhì)粒pFA6a-GFPS65T-KanMX6為模板,PCR擴(kuò)增G418抗性標(biāo)記基因,擴(kuò)增產(chǎn)物連接到pMD18-T載體,構(gòu)建pMD18-KanMX。然后分別對(duì)pMD18-KanMX和pYES2.0進(jìn)行NdeI/NheI雙酶切,凝膠回收基因片段并用T4連接酶連接。構(gòu)建表達(dá)載體pYES-KanMX質(zhì)粒,使pYES2.0的營(yíng)養(yǎng)缺陷標(biāo)記改變?yōu)镚418抗性標(biāo)記。將spt15和taf25易錯(cuò)PCR的片段經(jīng)相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶酶切,用T4連接酶連接經(jīng)同樣限制性內(nèi)切酶處理的表達(dá)載體pYES-KanMX,并轉(zhuǎn)化感受態(tài)的大腸桿菌DH5α,構(gòu)建表達(dá)載體的易錯(cuò)PCR文庫(kù)。提取轉(zhuǎn)錄因子spt15和taf25易錯(cuò)PCR表達(dá)載體突變文庫(kù)的質(zhì)粒,并用醋酸鋰的方法轉(zhuǎn)化感受態(tài)的釀酒酵母S.cerevisiaeCGMCC2846,以含120μg/mLG418的YPD培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)2~3d。將單菌落影印到新的含有120μg/mL的G418的YPD平板上。28℃培養(yǎng)3~5d。將pYES-KanMX空載體轉(zhuǎn)化釀酒酵母菌株,獲得酵母對(duì)照菌株。
2.4轉(zhuǎn)錄因子spt15和taf25突變基因轉(zhuǎn)化子的篩選和發(fā)酵性能研究將YPD-G418平板上生長(zhǎng)的酵母菌落保存于YPD斜面培養(yǎng)基上,分別接種于O-medium,200r/min,28℃條件下培養(yǎng)48h后用HPLC的方法測(cè)定SAM含量。將獲得SAM產(chǎn)量高于對(duì)照的陽性重組子,按2%的接種量接種于500mL錐形瓶(內(nèi)有100mLO-mediun培養(yǎng)基),控制起始的OD值一致,30℃、200r/min條件下培養(yǎng)。定時(shí)測(cè)定菌體OD600,繪制生長(zhǎng)曲線,并測(cè)定發(fā)酵液中SAM的產(chǎn)量。SAM測(cè)定采用HPLC的方法,具體是1.0mL發(fā)酵液與2.0mL1.5mol/L高氯酸混勻,40℃反應(yīng)0.5h,8000g離心10min,取上清過0.45μm備用。SAM含量用HPLC測(cè)定,色譜條件:江蘇漢邦C18柱(250mm×4.6mm,5μm),檢測(cè)波長(zhǎng)254nm;流動(dòng)相:0.1mol/L甲酸銨;體積流量:1.0mL/min;柱溫:40℃;進(jìn)樣體積:10μL。2.5突變體的遺傳穩(wěn)定性研究突變體在YPD斜面?zhèn)鞔?8h轉(zhuǎn)接一次,共傳代5次,將傳代后的菌種進(jìn)行生長(zhǎng)和發(fā)酵試驗(yàn),并與原代的菌株進(jìn)行比較,研究其SAM產(chǎn)量的傳代穩(wěn)定性。
3結(jié)果
3.1spt15和taf25基因的克隆以S.cerevisiaeCGMCC2846的基因組DNA為模板,利用設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到的PCR產(chǎn)物電泳檢測(cè)在0.75kb左右(圖1)。將PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后和克隆載體pMD18-T連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)的大腸桿菌DH5α,提取轉(zhuǎn)化子質(zhì)粒,將陽性克隆進(jìn)行基因序列測(cè)定,測(cè)序結(jié)果登陸NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果表明得到的SPT15和TAF25基因的序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因序列同源性100%。
3.2spt15和taf25基因易錯(cuò)PCR文庫(kù)的建立利用易錯(cuò)PCR試劑盒以質(zhì)粒pMD18-SPT15和pMD18-TAF25為模板進(jìn)行易錯(cuò)PCR,經(jīng)瓊脂糖電泳檢測(cè)易錯(cuò)PCR產(chǎn)物與PCR產(chǎn)物基本相同(圖2)。將spt15和taf25易錯(cuò)PCR的擴(kuò)增片段經(jīng)瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收后用于構(gòu)建表達(dá)載體的易錯(cuò)PCR文庫(kù)。