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衛生檢驗LIMS自主開發與運用

2021-4-9 | 衛生檢驗論文

作者:楊其帆 吳益生 熊建菁 徐敏鋼 史馬喜 謝凡明 單位:上海市閘北區疾病預防控制中心

實驗室信息管理系統(LaboratoryInformationManagementSystem,LIMS),是利用計算機網絡技術、數據庫技術等來對實驗室進行規范管理的計算機軟硬件系統[1],通過LIMS實驗室可以達到自動化運行、信息化管理和無紙化辦公的目的,對實驗室提高工作效率、降低運行成本起到重要的作用。LIMS作為信息管理系統,它有與其它管理系統不同的特性,它的系統設計方案必須嚴格遵循《檢測和校準實驗室能力的通用要求》[2]。作為對社會提供重要檢測數據的部門,衛生檢驗實驗室承擔著食品、水質、環境和職業衛生等分析檢驗的重要任務。

隨著實驗室檢測越來越向儀器化、痕量化和信息化發展,實驗室管理體系和質量控制也越來越嚴格。新形勢和新技術對實驗室整體運行效率、管理水平,特別是管理工具提出了進一步的要求。設計、開發及應用一套既能滿足當前業務需求,又能輔助領導決策的標準化實驗室信息管理系統,是實驗室建立完備的質量管理體系的重要技術支撐,也是體現實驗室規范化管理和創新化運作的必然要求。目前國內雖然有很多提供實驗室信息管理系統的廠商,但存在價格過高、需二次開發、不能完全與衛生檢驗實驗室運作體系相適應等問題,對提高衛生檢驗實驗室信息化能力的作用有限。在具備條件的基礎上,采用自主開發實驗室信息管理系統的方式無疑具有十分重要的意義。

1方法

1.1對自主開發的可行性進行分析

對項目進行成本和預收益計算,評價技術可行性和經濟可行性。實施的成本包括相關開發與安裝的協調管理費,實驗室信息管理系統初始化過程中的人員費用,實施時所用的日常消耗及培訓費用等。收益包括實驗室對委托任務回應時間的縮短、分析產能的提高,管理成本的減少,節省的資源,還包括服務效率的提高,分析數據及利用數據的能力加強等。根據收益是否大于成本的原則來判斷項目的可行性。

1.2實驗室運行情況需求分析

在對現既有流程進行歸納和整理的基礎上,收集實驗室報表資料,確定系統輸入輸出設計方法,設計需求表格,進行系統需求定義,劃分功能模塊,形成項目需求文檔。

1.3系統設計及開發的關鍵技術

1.3.1ISO/IEC17025:2005檢測和校準實驗室認可準則ISO/IEC17025:2005是由國際標準化組織和國際電工委員會最新發布的實驗室能力通用要求,旨在為實驗室建立質量、行政和技術運作的管理系統,以及為實驗室的客戶、法定管理機構對實驗室的能力進行確認或承認提供指南。

1.3.2統一建模語言統一建模語言(UnifiedModelingLan-guage,UML)是業務和軟件建模的標準語言,UML是用來對軟件密集系統進行可視化建模的一種語言。UML為面向對象開發的產品提供了說明、可視化和編制文檔等功能,可以為LIMS的需求分析和設計提供支持。

1.3.3開發環境采用微軟公司的VisualStudio.Net2005為開發平臺。VisualStudio.Net是一套完整的開發工具,用于生成Web應用程序、XMLWebservices、桌面應用程序和移動應用程序,兼容各種語言使用相同的集成開發環境(IDE)。開發語言采用C#(Csharp)。C#是一種先進的,面向對象的語言,通過C#可以快速建立基于Microsoft網絡平臺的實驗室信息管理系統,同時保持系統良好的運行性能和擴展性。

1.3.4各模塊的通信與協作模塊間的通信與協作,是實現實驗室管理協同工作所必須的。本系統的通信方式采取當前較為流行的混合(C/S與B/S)模式[3],C/S模式是客戶端/服務器模式,在這種模式中客戶端承擔了一部分的計算與處理工作,響應速度快,功能齊全,適用于儀器接口數據和原始數據的處理。原始記錄由于檢測項目計算公式和方法較多,涉及大量數據的錄入及計算,采用C/S模式可顯著提高效率。瀏覽器/服務器(B/S)結構是新一代的系統,它的組成3要素為:服務器(Server)、客戶瀏覽器(Browser)和網絡。服務器和瀏覽器都是利用網絡來發送請求和應答(windows中使用80端口進行通信),采用免安裝的B/S模式,用戶只需要打開瀏覽器就可以進行操作,極大降低了用戶端的維護工作。作為實驗室信息管理系統一個特殊的使用者,檢驗人員之間的通信交流,采取的是系統提供的內部短訊、電子郵件或公告板進行。

1.3.5LIMS與外部系統的接口在實施LIMS的過程中,自動采集各種分析儀器產生的數據是一項十分必要的功能,也是實施中最困難的一步。隨著越來越規范的接口標準,可以支持第三方接口的組件也越來越多。采用直接捕集組件(Di-rectCaptureUtility,DCU)[4],可以實現LIMS與分析儀器的雙向通信,且比較穩定。設備接口模塊可為各種常見的實驗室分析儀器與LIMS的直接連接提供自動化腳本,帶PC工作站的儀器,則采用開放式的數據接口與LIMS進行數據通信,使分析儀器獲得的結果數據直接自動傳輸到LIMS中,可以減少手工錄入的錯誤,減少檢測人員的工作量[5]。

1.4部署和運行成立專門的實施小組,明確職責,做到領導重視、責任到位、有令必行,做好人員的培訓工作,定期召開應用討論會議,對系統運行中發現的問題及時進行交流與溝通,提出解決方案,確保項目的順利推進。

2結果

2.1樣品檢測流程的運行情況

樣品登錄采用智能模板,將每份檢品卡的生成時間從兩分多鐘降低到十幾秒鐘,在樣品流程中采用條形碼標簽對樣品進行追蹤識別,任務分配實現了自動化,原始記錄的計算步驟遵循《GB/T8170-2008數據修約規則與極限數值的表示和判定》中的相關要求,實現了復雜公式的自動運算,檢測報告經過多級審核后自動生成、自動評價。閘北區疾病預防控制中心實驗室于2009年初開始運行自主開發的衛生檢驗實驗室信息管理系統,經過兩年多的運行,累計分析了幾千份檢測報告,數萬個檢測項目,顯著提高了管理效率,降低了人力、物力和時間成本。

2.2試劑耗材及標準物質管理

實現了對試劑基本信息管理、小于最低庫存時提醒、供應商管理及評價等功能。標準物質管理實現了標準物質配置記錄、標準物質余量狀態及標準證書管理等功能。極大提高了試劑及標準物質管理的效率,減少了因信息不及時給工作造成的額外損失。

2.3儀器信息管理

儀器管理模塊是實驗室管理中重要的組成部分,包括了儀器基本信息檔案信息、檢定情況、期間核查情況、儀器狀態等功能,可根據檢測周期自動提醒檢定、期間核查,可以查看每臺儀器測定的樣品項目及儀器合格、準用、停用的標識狀態。

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