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生物實(shí)驗(yàn)DNA提取方式整合

2021-4-9 | 生物科學(xué)論文

 

在中學(xué)教材中關(guān)于“DNA的粗提取與鑒定”這一實(shí)驗(yàn)的實(shí)際操作過程中,雖然現(xiàn)象明顯,但存在幾個問題:實(shí)驗(yàn)材料成本高[1];操作步驟較復(fù)雜;需要儀器較昂貴等。因此,一般中學(xué)很難開展[2]。針對上述問題,本實(shí)驗(yàn)做了部分改進(jìn),實(shí)驗(yàn)分別選用了新鮮的菜花和蒜黃作為材料,進(jìn)行比較實(shí)驗(yàn),試圖達(dá)到材料來源廣,試劑用量少,所需儀器少,操作更簡單,結(jié)果較明顯,一般普通中學(xué)均能開設(shè)的目的。從而有利該實(shí)驗(yàn)普及推廣,讓更多的中學(xué)生能從植物材料中提取DNA,增加學(xué)生的感性認(rèn)識,提高學(xué)生的動手能力。

 

1材料和方法

 

(1)材料

 

菜花和蒜黃。

 

(2)實(shí)驗(yàn)方法

 

以經(jīng)典的SDS提取方法[3]為對照:①分別稱取在-20℃條件下保存的兩種植物組織10g,在液氮的冷凍下迅速研磨成粉末。②加入提取液(100mMTris•HClpH8.5,100mMNaCl,50mMEDTApH8.0,2%SDS)20mL,充分研磨混勻,用兩層紗布過濾,用移液器分別吸取5mL濾液于10mL的離心管中。③將離心管置于65℃水浴中30min,水浴過程中溫和混勻幾次。④取出離心管,每管加入等體積的氯仿-異戊醇(V/V=1∶1)溶液,混勻后,10000rpm離心10min。⑤小心將上清液移入另一離心管中,不要吸入雜質(zhì),重復(fù)步驟④,將上清液小心移入另一新的離心管中。⑥加入0.6倍體積的異丙醇,輕輕混勻,靜置一段時間。6000rpm離心2min,倒去上清液,吹干。⑦用70%乙醇沖洗1次,然后用6000rpm離心2min。⑧吹干后加入2mL的100xTE,溶解。⑨貼上標(biāo)簽于-20℃冰箱保存。對照上述步驟對DNA提取做表1處理。

 

(3)鑒定DNA

 

①二苯胺鑒定法[4]吸取各種處理的DNA溶解液0.75mL于5mL的試管中,再加入0.75mL配好的二苯胺溶液,置于100℃沸水浴中10min,觀察離心管中顏色的變化。二苯胺溶液中加入DNA后會變藍(lán),DNA所含量越多,藍(lán)色就越深。②分光光度計鑒定法吸取各種處理的DNA溶解液0.5mL于比色皿中,加入1mL的水溶液,再在另一只同樣的比色皿中加入1.5mL的水溶液作空白對照,測定不同處理的DNA在260nm和280nm處的吸光值[5]。

 

2實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

 

(1)不同材料對DNA濃度的影響

 

菜花剪成小塊不易研磨,可能存在研磨不充分,提取量少等問題,這樣對DNA的濃度會有一定影響。而蒜黃剪成小段后,研磨明顯比菜花充分,提取量較多,但蒜黃中含有的多糖物質(zhì)較多,也會影響DNA的濃度。但就操作角度來看,采用蒜黃較好。

 

(2)不同處理方法對DNA提取的影響

 

溫度、液氮、氯仿-異戊醇和離心機(jī)等都是影響DNA提取的重要因素。因此本實(shí)驗(yàn)采用不同的處理方法來探討DNA的提取,以達(dá)到優(yōu)化實(shí)驗(yàn)的目的。①溫度對DNA提取很重要,低溫能更好地保持DNA不降解,見表2。液氮可使材料研磨充分。②氯仿-異戊醇起到了抽提蛋白質(zhì)的作用,能很好地去除所提溶液中的雜質(zhì),最后提出來的DNA濃度和純度均較好。③用靜置的方法代替離心機(jī),比較符合現(xiàn)在許多中學(xué)的現(xiàn)狀,即靜置后小心用吸管吸取上清液轉(zhuǎn)移到干凈的小燒杯中,能夠達(dá)到良好的提取效果。④加入異丙醇沉淀DNA,沉淀效果更好,而且用量是0.6倍的上清液的體積,菜花和蒜黃的效果都比較好,總體效果比加2倍體積的無水乙醇得到的沉淀更多。

 

(3)DNA鑒定

 

二苯胺鑒定法是中學(xué)常用的方法,此方法操作簡單,現(xiàn)象明顯。本實(shí)驗(yàn)中-20℃條件,氯仿-異戊醇的處理和異丙醇沉淀的DNA含量較多,能使二苯胺溶液變得較藍(lán)。說明DNA含量較高,通過分光光度計檢測260nm/280nm為1.75~2.0之間,純度較高,達(dá)到實(shí)驗(yàn)的要求。

 

3討論

 

提取DNA的方法有許多,常見的有CTAB法和SDS法等。但由于所用材料及中學(xué)實(shí)驗(yàn)條件的限制,所提取的效果不盡如人意[6]。本實(shí)驗(yàn)從中學(xué)實(shí)驗(yàn)條件著手,就DNA的SDS經(jīng)典提取方法中有幾處中學(xué)實(shí)驗(yàn)條件達(dá)不到的步驟做了不同處理。

 

經(jīng)過反復(fù)實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)材料采用蒜黃和菜花,在-20℃條件下,采用靜置的方法處理并用冷的異丙醇沉淀DNA,得到的DNA濃度和純度都較高,已經(jīng)能達(dá)到中學(xué)的要求,能較好地觀察到提取出來的DNA。經(jīng)過比較最終得到一種最適合于中學(xué)DNA提取實(shí)驗(yàn)的方法,即采用蒜黃為實(shí)驗(yàn)材料,在-20℃條件下,不用液氮,不用離心機(jī)而采用靜置,加入氯仿-異戊醇的方法。

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